Oito equipes classificaram para essa etapa da disputa. Na manhã desta sexta-feira (23), na sede da CBF, foram sorteados os confrontos das quartas de final da Copa do Brasil 2016. O vencedor da Copa do Brasil conquista uma vaga para a Taça Libertadores da América 2017. Confira os duelos definidos e o chaveamento até grande final. Os vencedores das chaves 1 e 3 fazem uma semifinal. O outro jogo da semifinal será disputado entre os vencedores das chaves 2 e 4. Juventude, Internacional, Palmeiras e Cruzeiro decidem a vaga para as semifinais em casa.
Chave 1 : Atlético-MG x Juventude
Chave 3: Santos x Internacional
Chave 2: x Grêmio x Palmeiras
Chave 4: Corinthians x Cruzeiro